Ефим Федотович Лискун уделяет большое внимание вопросам изучения породного состава крупного рогатого скота. Он провел ряд больших экспедиционных исследований по изучению животноводческих ресурсов нашей страны. В результате проведения этих исследований им опубликованы следующие работы: «Краткие сведения о животноводстве некоторых русских хозяйств» (1910, 1915), «Красный степной скот» (1911, 1912), «Ярославский скот» (1913, 1931), «Чем хорош русский северный скот» (1912), «Сибирский скот и пути его улучшения» (1926, 1928), «Русские отродья крупного рогатого скота» (1923), «Крупный рогатый скот по данным выставки в Чистопольском уезде, Казанской губернии» (1905) и др. В этих трудах Ефим Федотович дал глубокий анализ животноводства нашей страны применительно к отдельным породам и зонам и определил общие пути дальнейшего совершенствования скота. При анализе фактических материалов им постоянно подчеркивается единство организма и условий внешней среды. В этой связи он пишет: «Не существует вообще ни хороших, ни плохих пород крупного рогатого скота и все породы могут быть либо очень хорошими, либо очень плохими, смотря по тому, где и для каких целей и при каких условиях они содержатся».
Ефим Федотович считает, что в совершенствовании пород животных следует отводить решающую роль творческой деятельности людей, которая заключается прежде всего в согласовании всех наличных факторов, воздействующих в данном районе на конечные результаты хозяйствования. Эти положения имели и имеют огромное практическое значение. Они помогают зоотехникам правильно организовать племенную работу и повысить продуктивность колхозных и совхозных стад. Своими трудами Ефим Федотович способствовал значительному улучшению таких пород скота, как красная степная, ярославская и др. Его работы в дальнейшем послужили научной основой районирования пород крупного рогатого скота и дали возможность разработать общую типовую методику экспедиционных исследований целого ряда отдельных пород крупного рогатого скота.
