29 апреля 1866 г. Н. А. Меншуткин прочитал на заседании физико-математического факультета Петербург ского университета две пробные лекции, после чего был утвержден в звании приват-доцента. А с осени того же 1866 г. началась его педагогическая работа в Петербургском университете, которая продолжалась непрерывно более 35 лет вплоть до 1902 г., когда он перенес свою деятельность в только что открытый в столице Политехнический институт.
Осенью 1866 г. молодой приват-доцент читал студентам третьего и четвертого курсов специальный раздел органической химии — «Об органических соединениях, содержащих элементы группы азота». Первая лекция состоялась 22 сентября в присутствии профессоров и преподавателей физико-математического факультета. Она прошла с большим успехом: аудитория наградила начинающего лектора шумными аплодисментами. Маститые профессора поздравляли его с первыми шагами на педагогическом поприще.
С весны 1867 г. Николай Александрович вел занятия по аналитической химии со студентами второго курса. Одновременно он ежегодно читал студентам старших курсов специальные разделы органической химии — «Углеводороды», «Спирты», «Альдегиды и кетоны», «Кислоты» и другие.